Zur Startseite Zur Hauptnavigation Zum Inhalt Zum Kontakt Zur Suche Zur Sitemap
+A-
ENDE
  Menü
Sektion Experimentelle Virologie des Instituts für Medizinische Mikrobiologie
  Menü
Startseite / Forschung

Forschung

Aktuelle Projekte 

Feinstaub im Fokus: Auswirkungen auf Molekulare Mechanismen während Atemwegsinfektionen

Mit Förderung des BMFTR

 

Zusammenfassung: (Kurztitel: FeinInfekt)

Luftverschmutzung durch Feinstaub aus Industrie, Verkehr und der Verbrennung fossiler Brennstoffe gilt weltweit als bedeutendes Gesundheitsrisiko. Jedes Jahr sterben Millionen Menschen an den Folgen. Neben chronischen Atemwegserkrankungen wie Asthma oder chronische obstruktiven Lungenerkrankung (COPD) kann Feinstaub auch die körpereigene Abwehr schwächen – und damit die Anfälligkeit für Infektionen erhöhen. Besonders gefährdet sind Menschen mit geschwächtem Immunsystem. Infektionen mit Influenza-A-Viren (IAV) und/oder Schimmelpilzen wie Aspergillus fumigatus können bei ihnen schwere, teils lebensbedrohliche Lungeninfektionen auslösen. Erste Forschungsergebnisse deuten darauf hin, dass Luftverschmutzung die Ausbreitung und Schwere solcher Infektionen zusätzlich verstärken kann. Doch wie genau Feinstaubexposition das Zusammenspiel von Krankheitserregern und Immunsystem beeinflusst, ist bisher kaum erforscht. Ziel dieses Projektes ist es diese Wissenslücke zu schließen. Mit Hilfe verschiedener Zellkultur- und Gewebemodellen wird untersucht, wie Feinstaub die Ausbreitung von Krankheitserregern, die zelluläre Signalübertragung und die Immunreaktion beeinflusst. Die gewonnenen Erkenntnisse sollen zu einer besseren Beurteilung von schweren Krankheitsverläufen und der Identifikation von Angriffspunkten für neue Interventionsstrategien beitragen. Darüber hinaus leisten sie einen bedeutsamen Beitrag zur besseren Bewertung zukünftiger Gesundheitsrisiken durch Umweltverschmutzung und zur Entwicklung präventiver Maßnahmen.

Förderkennzeichen: 01KI2526

Projektlaufzeit: 01.01.2026 bis 30.06.2027

SFB 1278 Polytarget D02: Verpackungsoptimierung für antivirale und entzündungshemmende Wirkstoffe zur Behandlung von Infektionen der Atemwege durch Viren mit Pandemiepotential

https://www.polytarget.uni-jena.de/projekte/d02

Analysis of the newly discovered control of HSV-1 replication by the PP2A B-type subunit PR130

Mit Förderung der Deutschen Forschungsgemeinschaft: DFG Projektnummer 502534123

Projektleitung:   Prof. Dr. Andreas Henke, Sektion für Experimentelle Virologie, Institut für Medizinische Mikrobiologie, Universitätsklinikum Jena; Prof. Dr. Oliver Krämer, Institut für Toxikologie, Universitätsmedizin Mainz

Zusammenfassung:

Die Phosphatase-2A (PP2A) B-Untereinheit PR130/PPP2R3A kontrolliert die Aktivierung von Checkpoint-Kinasen und steuert somit den Ablauf des Zellzyklus und die genomische Integrität der Zelle. Virusinfektionen induzieren DNA-Replikationsstress, DNA-Schäden und verursachen die Aktivierung dieser Kinasen. Da bislang unbekannt ist, ob der PP2A-PR130 Komplex virale Replikationsabläufe beeinflusst, wurde in enger Zusammenarbeit der Projektleiter dieses Forschungsvorhaben erfolgreich etabliert.

Bisherige Daten zeigen, dass PR130 die Replikation von Herpes-simplex-Virus Typ 1 (HSV-1) im Zellkern unterdrückt und die Phosphorylierung und Stabilität von Checkpoint-Kinasen in infizierten Zellen reguliert. Basierend auf dem CRISPR-Cas9 Verfahren wird nunmehr untersucht, inwiefern PR130 die HSV-1-verursachten Veränderungen des Zellzyklus und der DNA-Reparaturmechanismen moduliert. In diesem Kontext werden zelluläre und virale Proteine mittels Proteomik-Analysen bestimmt, die durch den PP2A-PR130-Komplex kontrolliert werden. Der Einfluss klinisch anwendbarer Checkpoint-Kinase-Inhibitoren auf die Virusreplikation wird in relevanten Zellkultursystemen analysiert. Darüber hinaus wird auch der Einfluss der PP2A B-Untereinheit B56β auf die Replikation von HSV-1 untersucht.

Da bislang keine Publikationen zum Einfluss von PR130 auf die Replikation viraler Infektionserreger existieren, werden die Ergebnisse der geplanten Experimente die bestehende Datenlage signifikant erweitern.

Projektlaufzeit: 01.01.2023-31.12.2025 

Abgeschlossene Projekte

PNEUTHERA - Quantitative monitoring of tailored therapy against bacterial super-infection in viral pneumonia by spatiotemporal microscopy

https://www.infectooptics.de/de/pneuthera.html

Charakterisierung des antiviralen und möglichen entzündungshemmenden Wirkmechanismus von ProcCluster® während Influenza Virus bzw. SARS-CoV-2 Infektion

Mit Förderung des EUROPÄISCHEN FONDS FÜR REGIONALE ENTWICKLUNG (EFRE-OP 2014-2020) als Teil der Reaktion der Union auf die COVID-19-Pandemie (REACT-EU)

Kooperationspartner: inflamed pharma GmbH Jena

Zusammenfassung:

Zirkulierende Viren, wie immer wieder neu auftretende Influenza A Viren oder Coronaviren, hierzu gehört das schwere akute Respiratorische Syndrom Corona Virus-2 (SARS-CoV-2), stellen nach wie vor eine globale Belastung für die öffentliche Gesundheit dar. Im Allgemeinen teilen Influenza A Viren und Coronaviren das Pandemiepotenzial. Die Entwicklung effizienter Impfstoffe ist zeitaufwendig und spezifische antivirale Behandlungsstrategien sind rar. Die Zulassung von Substanzen, die bereits klinisch für andere Krankheiten verwendet werden, sind kurzfristig eine vielversprechende Option zur Behandlung von Infektionen. Hierbei sind pharmazeutische Substanzen die Virus-unterstützende zelluläre Faktoren oder überschießende Immunreaktionen hemmen bzw. Entzündungsprozesse auflösen von besonderem Interesse. Erste Untersuchungen deuten auf eine hemmende Wirkung von ProcCluster®, einem Lokalanästhetikum mit entzündungshemmenden Eigenschaften, sowohl auf Influenza A Virus als auch auf SARS-CoV-2 Vermehrung und Verbreitung in vitro hin.

Während der Förderung durch den EUROPÄISCHEN FONDS FÜR REGIONALE ENTWICKLUNG – EUROPA FÜR THÜRINGEN werden in Kooperation mit der inflamed pharma GmbH Jena die Regulation der antiviralen und möglichen entzündungshemmenden Wirkung von ProcCluster® und ProcCluster®-haltigen Produkten während Influenza A Virus bzw. SARS-CoV-2 Infektion in vitro näher charakterisiert. Die Aufklärung der molekularen und regulatorischen Mechanismen von ProcCluster® und ProcCluster®-haltigen Produkten während viraler Infektion ist notwendig, um zunächst Grundlagen zur Einschätzung des Potentials von ProcCluster® und ProcCluster®-haltigen Produkten für eine spezifische Anwendbarkeit bei Influenza A Virus oder SARS-CoV-2 Infektion zu erhalten.

Publikation:

  • Häring, C.; Jungwirth, J.; Schroeder, J.; Löffler, B.; Engert, B.; Ehrhardt, C. The Local Anaesthetic Procaine Prodrugs ProcCluster® and Procaine Hydrochloride Impair SARS-CoV-2 Replication and Egress In Vitro. Int. J. Mol. Sci. 2023, 24, 14584. https://doi.org/10.3390/ijms241914584

  • Häring C, Schroeder J, Jungwirth J, Löffler B, Henke A, Engert B and Ehrhardt C (2024) ProcCluster® and procaine hydrochloride inhibit the replication of influenza A virus in vitro. Front. Microbiol. 15:1422651.
    https://doi.org/10.3389/fmicb.2024.1422651

COMDRUG-CoV-2: Die Wirkung häufig eingenommener Medikamente auf das alveolare Gleichgewicht während einer SARS-CoV-2-Infektion

Mit Förderung des BMBF

Zusammenfassung:

Ziel des Projektes ist es, unter Verwendung eines komplexen humanen Alveolus-on-a-Chip Modells, einem Modell, das Bedingungen der menschlichen Lunge nachahmt, die Pathophysiologie der SARS-CoV-2 Infektion zu untersuchen. Dabei soll die Wirkung von Substanzen gegen allgemeine Erkältungskrankheiten, Herz-Kreislauf-Erkrankungen und überschießende Immunantwort getestet werden. Insbesondere deren Wirkung auf Vermehrung und Verbreitung von SARS-CoV-2 im Epithel und Endothel, die Aktivierung von Entzündungsparametern und Schädigung der Zellbarrieren wird analysiert. Darüber hinaus werden SARS-CoV-2 induzierte Effekte auf Endothelzellen und die von diesen ausgehende Funktionen auf das vaskuläre System näher betrachtet, da dieses bei schweren COVID-19 Verläufen zu Blutgerinnungsstörungen und Thrombenbildung führen können.

Projektlaufzeit: 01.05.2020 bis 30.01.2022

Publikationen:

  • Deinhardt-Emmer S, Böttcher S, Häring C, Giebeler L, Henke A, Zell R, Jungwirth J, Jordan PM, Werz O, Hornung F, Brandt C, Marquet M, Mosig AS, Pletz MW, Schacke M, Rödel J, Heller R, Nietzsche S, Löffler B, Ehrhardt C. 2021. SARS-CoV-2 causes severe epithelial inflammation and barrier dysfunction. J Virol doi:10.1128/JVI.00110-21.

  • Jungwirth J, Häring C, König S, Giebeler L, Doshi H, Brandt C, Deinhardt-Emmer S, Löffler B, Ehrhardt C. 2022. D,L-Lysine-Acetylsalicylate + Glycine (LASAG) Reduces SARS-CoV-2 Replication and Shows an Additive Effect with Remdesivir. Int. J. Mol. Sci., 2022, 23 (13), 6880. https://doi.org/10.3390/ijms23136880 (registering DOI) - 21 Jun 2022

Infektiosität der Covid-19-Patienten über die Dauer der Erkrankung

Mit Förderung der Carl-Zeiss-Stiftung

Zusammenfassung:

Die Diagnostik einer Infektion mit SARS-CoV2 erfolgt über den Nachweis von genetischem Material des Virus mittels Reverse-Transkriptase-quantitativer Polymerase-Kettenreaktion (RT-qPCR). In Proben von COVID-19-Patienten lässt sich genetisches Material allerdings oft 14 Tage und länger nachweisen, obwohl die Patienten keine Symptome mehr zeigen. Die Infektiosität von COVID-19-Patienten kann über die Anzucht und Bestimmung infektiöser Viruspartikel in Zellkultursystemen mittels sog. Plaquetitration ermittelt werden. Diese Methode ist jedoch sehr zeitaufwendig und deshalb nicht für die Routinediagnostik geeignet. In dem Projekt werden beide Methoden eingesetzt, um über die Dauer der Erkrankung tatsächlich vorliegendes infektiöses Material zu ermitteln und mit den Werten der RT-qPCR  zu vergleichen. Weiterhin ist es Ziel des Projektes eine Methode zu entwickeln, die den Nachweis von infektiösem Material auch in der Routinediagnostik erlaubt.

Projektlaufzeit: 01.05.2020 bis 30.01.2021

Publikation: Deinhardt-Emmer S, Wittschieber D, Sanft J, Kleemann S, Elschner S, Haupt KF, Vau V, Häring C, Rödel J, Henke A, Ehrhardt C, Bauer M, Philipp M, Gassler N, Nietzsche S, Löffler B, Mall G. 2021. Early postmortem mapping of SARS-CoV-2 RNA in patients with COVID-19 and the correlation with tissue damage. Elife 10: e60361.

Pressemitteilung

Infektiosität von Verstorbenen, die an Covid-19 erkrankt waren

Mit Förderung der Carl-Zeiss-Stiftung

Kooperationspartner:
Institut für Medizinische Mikrobiologie (Prof. Dr. Bettina Löffler)
und Institut für Rechtsmedizin (Prof. Dr. Gita Mall)

Zusammenfassung:

Es wird untersucht, ob in Verstorbenen infektiöse SARS-CoV2 nachweisbar sind und ob von diesen eine Gefährdung ausgeht. Da derzeit wenige Informationen diesbezüglich vorliegen, ist geplant, verschiedene Organe auf die potentielle Infektiosität zu untersuchen.

Projektlaufzeit: 01.05.2020 bis 30.01.2021

Publikation: Deinhardt-Emmer S, Wittschieber D, Sanft J, Kleemann S, Elschner S, Haupt KF, Vau V, Häring C, Rödel J, Henke A, Ehrhardt C, Bauer M, Philipp M, Gassler N, Nietzsche S, Löffler B, Mall G. 2021. Early postmortem mapping of SARS-CoV-2 RNA in patients with COVID-19 and the correlation with tissue damage. Elife 10: e60361.

Pressemitteilung

Publikationen 

2026

1. Zell R, Groth M, Selinka L, Selinka HC.  A metagenomic analysis of urban river samples reveals high numbers of sequences related to mycoviruses. Arch Virol. 2026 171(2). https://doi.org/10.1007/s00705-025-06496-y

2025

1. Jungwirth J, Mieland AO, Piée-Staffa A, Heimburg T, Brenner W, Ehrhardt C, Sippl W, Henke A, Krämer OH. Pharmacologically induced proteolysis of histone deacetylase-6 attenuates influenza virus replication despite limited anti-tumor effects. Life Sciences, 2025, 123401. https://doi.org/10.1016/j.lfs.2025.123401

2. Tietjen I, Kwan DC, Petrich A, Zell R, Antoniadou IT, Gavriilidou A, Tzitzoglaki C, Rallis M, Fedida D, Sureda FX, Mestdagh C, Naesens L, Chiantia S, Johnson FB, Kolocouris A. Antiviral mechanisms and preclinical evaluation of amantadine analogs that continue to inhibit influenza A viruses with M2S31N-based drug resistance. Antiviral Res. 2025 Apr;236:106104. https://doi.org/10.1016/j.antiviral.2025.106104

3. Schroeder J, Westhoff J, Vilotijević I, Werz O, Hoeppener S, Löffler B, Fischer D, Ehrhardt C. Anti-Influenza Activity of 6BIGOE: Improved Pharmacological Profile After Encapsulation in PLGA Nanoparticles. Int. J. Mol. Sci. 2025, 26, 4235. https://doi.org/10.3390/ijms26094235 

4. Richter M,  Khrenova M, Riabova O, Makarov V, Schmidtke M. Formation of a triple complex of viral capsid protein 1 and two capsid-binding inhibitors explains synergistic interactions observed in combination studies with rhinoviruses. Biomedicine & Pharmacotherapy 2025, 16, 118193. https://doi.org/10.1016/j.biopha.2025.118193

5. Giebeler L, Ehrhardt C, Häder A, Lauf T, Deinhardt-Emmer S, Löffler B. Colonizing Bacteria Aggravate Inflammation, Cytotoxicity and Immune Defense During Influenza A Virus Infection. Int. J. Mol. Sci. 2025, 26, 5364. https://doi.org/10.3390/ijms26115364

6. Jungwirth J, Siegert L, Gauthier L, Henke A, Krämer OH, Engert B, Ehrhardt C. The Procaine-Based ProcCluster® Impedes the Second Envelopment Process of Herpes Simplex Virus Type 1. Int. J. Mol. Sci. 2025, 26, 7185. https://doi.org/10.3390/ijms26157185

7. Klement L, Ismail J, Schroeder J, Godbole A, Schreiber J, Weber C, Cseresnyés Z, Figge, MT, Löffler B, Schubert US, Schubert S, Ehrhardt C, Hoffmann C. Evaluating the antiviral efficacy of encapsulated PKC inhibitor BIM-I against influenza A virus infection. Adv Healthc Mater. 2025, Nov. 22:e04060.  https://doi.org/10.1002/adhm.202504060

8. Schroeder J, Ismail J, Holick CT, Jungwirth J, Klement L, Hoeppener S, Kosan C, Schmidtke M, Löffler B, Weber C, Schubert US, Hoffmann C, Schubert S, Ehrhardt C.  Advancing influenza virus treatment: in vitro and ex vivo studies of PI3K inhibitorloaded lipid nanoparticles. Mater Today Bio. 2025 Nov 26;35:102587. https://doi.org/10.1016/j.mtbio.2025.102587

9. Gauthier L, Koceva H, Bachelot Y, Koutstaal RW, van Kasteren PB, Figge MT, Eggeling C, Mosig AS. Generation of an induced pluripotent stem cell-derived alveolar type II in vitro mode to study influenza A virus infection and drug treatments. Adv Healthc Mater. 2025 Dec 30:e05141. https://advanced.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/adhm.202405141

 

2024

1. Jordan, P.M., Günther, K., Nischang, V., Ning, Y., Deinhardt-Emmer, S., Ehrhardt, C., Werz, O., Influenza A virus selectively elevates prostaglandin E2 formation in pro-resolving macrophages, ISCIENCE (2024), doi: https://doi.org/10.1016/j.isci.2023.108775

2. König S, Schroeder J, Nietzsche S, Heinekamp T, Brakhage AA, Zell R, Löffler B, Ehrhardt C. The influenza A virus promotes fungal growth of Aspergillus fumigatus via direct interaction in vitro. Microbes Infect. 2024 Mar-Apr;26(3):105264. doi: 10.1016/j.micinf.2023.105264. 

3. Häring C, Schroeder J, Jungwirth J, Löffler B, Henke A, Engert B and Ehrhardt C (2024) ProcCluster® and procaine hydrochloride inhibit the replication of influenza A virus in vitro. Front. Microbiol. 15:1422651. doi: 10.3389/fmicb.2024.1422651

4. Zell R, Groth M, Selinka L, Selinka HC. Diversity of Picorna-Like Viruses in the Teltow Canal, Berlin, Germany. Viruses. 2024 Jun 25;16(7):1020. doi: 10.3390/v16071020. 

5. Richter M, Döring K, Blaas D, Riabova O, Khrenova M, Kazakova E, Egorova A, Makarov V, Schmidtke M. Molecular mechanism of rhinovirus escape from the Pyrazolo[3,4-d]pyrimidine capsid-binding inhibitor OBR-5-340 via mutations distant from the binding pocket: Derivatives that brake resistance. Antiviral Res. 2024 Feb;222:105810. doi: 10.1016/j.antiviral.2024.105810.

6. Tsedilin A, Schmidtke M, Monakhova N, Leneva I, Falynskova I, Khrenova M, Lane TR, Ekins S, Makarov V. Indole-core inhibitors of influenza a neuraminidase: iterative medicinal chemistry and molecular modeling. Eur J Med Chem. 2024 Aug 15;277:116768. doi: 10.1016/j.ejmech.2024.116768. 

7. Richter M, Khrenova M, Kazakova E, Riabova O, Egorova A, Makarov V, Schmidtke M. Dynamic features of virus protein 1 and substitutions in the 3-phenyl ring determine the potency and broad-spectrum activity of capsid-binding pyrazolo[3,4-d]pyrimidines against rhinoviruses. Antiviral Res. 2024 Sep 2:105993. doi: 10.1016/j.antiviral.2024.105993. 

8. Günther K, Ehrhardt C, Werz O, Jordan P.M. Protocol for lipid mediator profiling and phenotyping of human M1- and M2-monocyte-derived macrophages during host-pathogen interactions. STAR Protocols. 2024 Sep 20. Volume 5, Issue 3. 103142, ISSN 2666-1667. https://doi.org/10.1016/j.xpro.2024.103142.

9. König S, Schroeder J, Heinekamp T, Brakhage AA, Löffler B, Engert B and Ehrhardt C. ProcCluster® and procaine hydrochloride inhibit the growth of Aspergillus species and exert antimicrobial properties during coinfection with influenza A viruses and A. fumigatus in vitro. Front. Cell. Infect. Microbiol. 2024 14:1445428. doi: 10.3389/fcimb.2024.1445428

10. Zell R, Groth M, Selinka L, Selinka HC. Metagenomic Analyses of Water Samples of Two Urban Freshwaters in Berlin, Germany, Reveal New Highly Diverse Invertebrate Viruses. Microorganisms. 2024 Nov 19;12(11):2361. doi: 10.3390/microorganisms12112361. 

 

2023

  1. Doshi H, Spengler K, Godbole A, Gee YS, Baell J, Oakhill JS, Henke A, Heller R. 2023. AMPK protects endothelial cells against HSV-1 replication via inhibition of mTORC1 and ACC1. Microbiol Spectr doi:10.1128/spectrum.00417-23:e0041723.
  2. Egorova A, Richter M, Khrenova M, Dietrich E, Tsedilin A, Kazakova E, Lepioshkin A, Jahn B, Chernyshev V, Schmidtke M, Makarov V. 2023. Pyrrolo[2,3-e]indazole as a novel chemotype for both influenza A virus and pneumococcal neuraminidase inhibitors. RSC Adv 13:18253-18261.
  3. Häring C, Jungwirth J, Schroeder J, Löffler B, Engert B, Ehrhardt C. 2023. The local anaesthetic procaine prodrugs ProcCluster® and procaine hydrochloride impair SARS-CoV-2 replication and egress in vitro. Int. J. Mol. Sci.2023, 24(19), 14584; https://doi.org/10.3390/ijms241914584.
  4. Hornung F, Schulz L, Köse-Vogel N, Hader A, Griesshammer J, Wittschieber D, Autsch A, Ehrhardt C, Mall G, Löffler B, Deinhardt-Emmer S. 2023. Thoracic adipose tissue contributes to severe virus infection of the lung. Int J Obes (Lond) doi:10.1038/s41366-023-01362-w.
  5. Langeder J, Döring K, Schmietendorf H, Grienke U, Schmidtke M, Rollinger JM. 2023. (1)H NMR-Based Biochemometric Analysis of Morus alba Extracts toward a Multipotent Herbal Anti-Infective. J Nat Prod 86:8-17.
  6. Vogel C, Wetzel L, Wutzler P, Gruhn B. 2023. Treatment with brivudine in immunocompromised pediatric patients with herpes zoster. Chemotherapy doi:10.1159/000531034.

  7. Stampolaki M, Hoffmann A, Tekwani K, Georgiou K, Tzitzoglaki C, Ma C, Becker S, Schmerer P, Döring K, Stylianakis I, Turcu AL, Wang J, Vazquez S, Andreas LB, Schmidtke M, Kolocouris A. 2023. A Study of the Activity of Adamantyl Amines against Mutant Influenza A M2 Channels Identified a Polycyclic Cage Amine Triple Blocker, Explored by Molecular Dynamics Simulations and Solid-State NMR. ChemMedChem 18:e202300182.

  8. van der Loos LM, De Coninck L, Zell R, Lequime S, Willems A, De Clerck O, Matthijnssens J. 2023. Highly divergent CRESS DNA and picorna-like viruses associated with bleached thalli of the green seaweed Ulva. Microbiol Spectr 11:e0025523.

  9. Schmidtke M, Bock HH, Cornberg M, Duwe S, Glebe D, Kaiser R, Knops E, Jensen BEO, Mertens T, Pletz MW, Protzer U, Sauerbrei A, Stahlmann R, Timm J. 2023. Virostatika. Infektionstherapie (Thiemeverlag) Seite 379 ff. 
  10. Zell R, Groth  M, Selinka L, Selinka HC. Exploring the Diversity of Plant-Associated Viruses and Related Viruses in Riverine Freshwater Samples Collected in Berlin, Germany. Pathogens 2023, 12, 1458. https://doi.org/10.3390/pathogens12121458.
  11. Langeder J, Koch M, Schmietendorf H, Tahir A, Grienke U, Rollinger JM, Schmidtke M. Correlation of bioactive marker compounds of an orally applied Morus alba root bark extract with toxicity and efficacy in BALB/c mice. Front Pharmacol. 2023 Dec 8;14:1193118. doi: 10.3389/fphar.2023.1193118. PMID: 38143489; PMCID: PMC10739329.

2022

1. Wagner E, Shin A, Tukhanova N, Turebekov N , Nurmakhanov T, Sutyagin V, Berdibekov A, Maikanov N, Lezdinsh I, Shapiyeva Z, Shevtsov A, Freimüller K, Peintner L, Ehrhardt C, Essbauer S. 2022. First Indications of Omsk Haemorrhagic Fever Virus beyond Russia. Viruses 14, 754.

2. Döring K, Langeder J, Duwe S, Tahir A, Grienke U, Rollinger JM, Schmidtke M. 2022. Insights into the direct anti-influenza virus mode of action of Rhodiola rosea. Phytomedicine 96:153895.

3. Zell R, Groth M, Selinka L, Selinka HC. Front Microbiol. 2022. Picrona-Like Viruses of the Havel River, Germany. Frontiers Microbiol. 4;13:865287.

4. Jungwirth J, Häring C, König S, Giebeler L, Doshi H, Brandt C, Deinhardt-Emmer S, Löffler B, Ehrhardt C. 2022. D,L-Lysine-Acetylsalicylate + Glycine (LASAG) Reduces SARS-CoV-2 Replication and Shows an Additive Effect with Remdesivir. Int. J. Mol. Sci., 23 (13), 6880.

5. Wagner E, Tukhanova N, Shin A, Turebekov N, Shapiyeva Z, Shevtsov A, Nurmakhanov T, Sutyagin V, Berdibekov A, Maikanov N, Lezdinsh I, Freimüller K, Ehmann R, Ehrhardt C, Essbauer S, Peintner L. 2022. Incidence of tick‑borne spotted fever group Rickettsia species in rodents in two regions in Kazakhstan. Sci Rep. 12(1):14872. doi: 10.1038/s41598-022-19145-0.

6. Tukhanova N, Shin A, Turebekov N, Nurmakhanov T, Abdiyeva K, Shevtsov A, Yerubaev T, Tokmurziyeva G, Berdibekov A, Sutyagin V, Maikanov N, Zakharov A, Lezdinsh I, Yeraliyeva L, Froeschl G, Hoelscher M, Frey S, Wagner E, Peintner L, Essbauer S. Molecular Characterisation and Phylogeny of Tula Virus in Kazakhstan. Viruses. 2022 Jun 9;14(6):1258. 

7. Shin A, Tukhanova N, Ndenkeh J Jr, Shapiyeva Z, Yegemberdiyeva R, Yeraliyeva L, Nurmakhanov T, Froeschl G, Hoelscher M, Musralina L, Toktasyn Y, Gulnara Z, Sansyzbayev Y, Aigul S, Abdiyeva K, Turebekov N, Wagner E, Peintner L, Essbauer S. Tick-borne encephalitis virus and West-Nile fever virus as causes of serous meningitis of unknown origin in Kazakhstan
Zoonoses Public Health. 2022 Aug;69(5):514-525. 

8. Langeder J, Döring K, Schmietendorf H, Grienke U, Schmidtke M, Rollinger JM. 1H NMR-Based Biochemometric Analysis of Morus alba Extracts toward a Multipotent Herbal Anti-Infective. J Nat Prod. 2022 Dec 21. doi: 10.1021/acs.jnatprod.2c00481. Online ahead of print.

9. Tzitzoglaki C, Hoffmann A, Turcu AL, Schmerer P, Laros G, Ma C, Liolios C, Wang J, Vázquez S, Schmidtke M, Kolocouris A. Amantadine variant – aryl conjugates that inhibit multiple M2 mutant – amantadine resistant influenza a viruses. Eur J Med Chem Reports, Volume 6, December 2022, 100083.

10. Zell R, Groth M, Selinka L, Selinka HC. Hepeliviruses in two waterbodies in Berlin, Germany. Arch Virol. 2022 Dec 25;168(1):9.

 

2021

1. Batram M, Witte J, Schwarz M, Hain J, Ultsch B, Steinmann M, Bhavsar A, Wutzler P, Criée C-P, Hermann C, Wahle K, Füchtenbusch M, Greiner W. 2021. Burden of Herpes Zoster in Adult Patients with Underlying Conditions: Analysis of German Claims Data, 2007-2018. Dermatol Ther 11(3):1009-1026, doi: 10.1007/s13555-021-00535-7.

2. Dastjerdi A, Everest DJ, Davies H, Denk D, Zell R. 2021. A novel dicistrovirus in a captive red squirrel (Sciurus vulgaris). J Gen Virol 102.

3. Deinhardt-Emmer S, Böttcher S, Häring C, Giebeler L, Henke A, Zell R, Jungwirth J, Jordan PM, Werz O, Hornung F, Brandt C, Marquet M, Mosig AS, Pletz MW, Schacke M, Rödel J, Heller R, Nietzsche S, Löffler B, Ehrhardt C. 2021. SARS-CoV-2 causes severe epithelial inflammation and barrier dysfunction. J Virol doi:10.1128/JVI.00110-21.

4. Deinhardt-Emmer S, Jäckel L, Häring C, Böttcher S, Wilden JJ, Glück B, Heller R, Schmidtke M, Koch M, Löffler B, Ludwig S, Ehrhardt C. 2021. Inhibition of Phosphatidylinositol 3-Kinase by Pictilisib Blocks Influenza Virus Propagation in Cells and in Lungs of Infected Mice. Biomolecules 11.

5. Deinhardt-Emmer S, Wittschieber D, Sanft J, Kleemann S, Elschner S, Haupt KF, Vau V, Häring C, Rodel J, Henke A, Ehrhardt C, Bauer M, Philipp M, Gassler N, Nietzsche S, Löffler B, Mall G. 2021. Early postmortem mapping of SARS-CoV-2 RNA in patients with COVID-19 and the correlation with tissue damage. Elife 10.

6. Duwe SC, Schmidt B, Gartner BC, Timm J, Adams O, Fickenscher H, Schmidtke M. 2021. Prophylaxis and treatment of influenza: options, antiviral susceptibility, and existing recommendations. GMS Infect Dis 9:Doc02.

7. Egerer R, Edel B, Löffler B, Henke A, Rödel J. 2021. Performance of the RT-LAMP-based eazyplex(R) SARS-CoV-2 as a novel rapid diagnostic test. J Clin Virol 138:104817.

Goder A, Ginter T, Heinzel T, Stroh S, Fahrer J, Henke A, Kramer OH. 2021. STAT1 N-terminal domain discriminatively controls type I and type II IFN signaling. Cytokine 144:155552.

8. Rose R, Brunnemann AK, Baukmann S, Buhler S, Fickenscher H, Sauerbrei A, Zell R, Krumbholz A. 2021. Antiviral susceptibility of recombinant Herpes simplex virus 1 strains with specific polymerase amino acid changes. Antiviral Res 195:105166.

9. Stankova, I.G., Chayrov, R., Schmidtke, M., Danalev, D.L., Ognichenko, L.N., Artemenko, A.G., Shap-kin, V.A., Kuz'min, V.E. Quantitative structure-activity relationship modelling of influenza \M2 ion chan-nels inhibitors, Journal of the Serbian Chemical Society, 2021, 86 (7-8) , pp.625-637

10. Tran GVQ, Kleinehr J, Preugschas HF, Anhlan D, Mohamed FF, Ehrhardt C, Ludwig S, Hrincius ER. 2021. Nonsense-mediated mRNA decay does not restrict influenza A virus propagation. Cell Microbiol doi:10.1111/cmi.13323.

11. Wilden JJ, Jacob JC, Ehrhardt C, Ludwig S, Boergeling Y. 2021. Altered Signal Transduction in the Immune Response to Influenza Virus and S. pneumoniae or S. aureus Co-Infections. Int J Mol Sci 22.

12. Zell R, Knowles NJ, Simmonds P. 2021. A proposed division of the family Picornaviridae into subfamilies based on phylogenetic relationships and functional genomic organization. Arch Virol 166:2927-2935.

2020

  1. Bohm K, Strompl J, Krumbholz A, Zell R, Krause G, Sievers C. 2020. Establishment of a Highly Sensitive Assay for Detection of Hepatitis E Virus-Specific Immunoglobulins. Journal of Clinical Microbiology 58.
  2. Bunke J, Receveur K, Oeser AC, Gutsmann I, Schubert S, Podschun R, Zell R, Fickenscher H, Krumbholz A. 2020. Epidemiology of bacteria and viruses in the respiratory tract of humans and domestic pigs. Apmis 128:451-462.
  3. Chayrov R, Parisis NA, Chatziathanasiadou MV, Vrontaki E, Moschovou K, Melagraki G, Sbirkova-Dimitrova H, Shivachev B, Schmidtke M, Mitrev Y, Sticha M, Mavromoustakos T, Tzakos AG, Stankova I. 2020. Synthetic Analogues of Aminoadamantane as Influenza Viral Inhibitors-In Vitro, In Silico and QSAR Studies. Molecules 25.
  4. Dastjerdi A, Benfield C, Everest D, Stidworthy MF, Zell R. 2020. Novel enteric viruses in fatal enteritis of grey squirrels. Journal of General Virology 101:746-750.
  5. Deckert V, Deckert-Gaudig T, Cialla-May D, Popp J, Zell R, Deinhardt-Emmer S, Sokolov AV, Yi Z, Scully MO. 2020. Laser spectroscopic technique for direct identification of a single virus I: Faster CARS. Proc Natl Acad Sci U S A. 2020 Nov 10;117(45):27820-27824.
  6. Deinhardt-Emmer S, Rennert K, Schicke E, Cseresnyes Z, Windolph M, Nietzsche S, Heller R, Siwczak F, Haupt KF, Carlstedt S, Schacke M, Figge MT, Ehrhardt C, Löffler B, Mosig AS. 2020. Co-infection with Staphylococcus aureus after primary influenza virus infection leads to damage of the endothelium in a human alveolus-on-a-chip model. Biofabrication 12:025012.
  7. Dzulko M, Pons M, Henke A, Schneider G, Krämer O H. 2020 The PP2A subunit PR130 is a key regulator of cell development and oncogenic transformation. BBA – Rev. Cancer 1874: 188453.
  8. Egorova A, Kazakova E, Jahn B, Ekins S, Makarov V, Schmidtke M. 2020. Novel pleconaril derivatives: Influence of substituents in the isoxazole and phenyl rings on the antiviral activity against enteroviruses. Eur J Med Chem 188:112007.
  9. Eiden S, Dijkman R, Zell R, Fuchs J, Kochs G. 2020. Using a mouse-adapted A/HK/01/68 influenza virus to analyse the impact of NS1 evolution in codons 196 and 231 on viral replication and virulence. Journal of General Virology 101:587-598.
  10. Graber K, Khan F, Glück B, Weigel C, Marzo S, Doshi H, Ehrhardt C, Heller R, Gräler M, Henke A. 2020. The role of sphingosine-1-phosphate signaling in HSV-1-infected human umbilical vein endothelial cells. Virus Res 276:197835.
  11. Huber R, Augsten S, Kirsten H, Zell R, Stelzner A, Thude H, Eidner T, Stuhlmüller B, Ahnert P, Kinne RW. 2020. Identification of New, Functionally Relevant Mutations in the Coding Regions of the Human Fos and Jun Proto-Oncogenes in Rheumatoid Arthritis Synovial Tissue. Life (Basel). 2020 Dec 23;11(1):E5. 
  12. Langeder J, Grienke U, Chen Y, Kirchmair J, Schmidtke M, Rollinger JM. 2020. Natural products against acute respiratory infections: Strategies and lessons learned. J Ethnopharmacol 248:112298.
  13. Langeder J, Grienke U, Döring K, Jafari M, Ehrhardt C, Schmidtke M, Rollinger JM. 2020. High-performance Countercurrent Chromatography to Access Rhodiola rosea Influenza Virus Inhibiting Constituents. Planta Med doi:10.1055/a-1228-8473.
  14. Lapuente D, Stab V, Storcksdieck Genannt Bonsmann M, Maaske A, Koster M, Xiao H, Ehrhardt C, Tenbusch M. 2020. Innate signalling molecules as genetic adjuvants do not alter the efficacy of a DNA-based influenza A vaccine. PLoS One 15:e0231138.
  15. Reckziegel M, Weber-Osel C, Egerer R, Gruhn B, Kubek F, Walther M, Wilhelm S, Zell R, Krumbholz A. 2020. Viruses and atypical bacteria in the respiratory tract of immunocompromised and immunocompetent patients with airway infection. European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases 39:1581-1592.
  16. Rodel J, Egerer R, Suleyman A, Sommer-Schmid B, Baier M, Henke A, Edel B, Löffler B. 2020. Use of the variplex SARS-CoV-2 RT-LAMP as a rapid molecular assay to complement RT-PCR for COVID-19 diagnosis. J Clin Virol 132:104616.
  17. Schicke E, Cseresnyes Z, Rennert K, Vau V, Haupt KF, Hornung F, Nietzsche S, Swiczak F, Schmidtke M, Glück B, Koch M, Schacke M, Heller R, Mosig AS, Figge MT, Ehrhardt C, Löffler B, Deinhardt-Emmer S. 2020. Staphylococcus aureus Lung Infection Results in Down-Regulation of Surfactant Protein-A Mainly Caused by Pro-Inflammatory Macrophages. Microorganisms 8.
  18. Schreiber A, Liedmann S, Brunotte L, Anhlan D, Ehrhardt C, Ludwig S. 2020. Type I interferon antagonistic properties of influenza B virus polymerase proteins. Cell Microbiol 22:e13143.
  19. Simmonds P, Gorbalenya AE, Harvala H, Hovi T, Knowles NJ, Lindberg AM, Oberste MS, Palmenberg AC, Reuter G, Skern T, Tapparel C, Wolthers KC, Woo PCY, Zell R. 2020. Recommendations for the nomenclature of enteroviruses and rhinoviruses (vol 171, pg 561, 2020). Archives of Virology 165:1515-1515.
  20. Tzitzoglaki C, McGuire K, Lagarias P, Konstantinidi A, Hoffmann A, Fokina NA, Ma C, Papanastasiou IP, Schreiner PR, Vazquez S, Schmidtke M, Wang J, Busath DD, Kolocouris A. 2020. Chemical Probes for Blocking of Influenza A M2 Wild-type and S31N Channels. ACS Chem Biol 15:2331-2337.
  21. Walther C, Döring K, Schmidtke M. 2020. Comparative in vitro analysis of inhibition of rhinovirus and influenza virus replication by mucoative secretolytic agents and plant extracts. BMC Complement Med Ther. 2020 Dec 23;20(1):380.
  22. Wilden JJ, Hrincius ER, Niemann S, Boergeling Y, Löffler B, Ludwig S, Ehrhardt C. 2020. Impact of Staphylococcus aureus Small Colony Variants on Human Lung Epithelial Cells with Subsequent Influnenza Virus Infection. Microorganisms. 2020 Dec 15;8(12):1998.
  23. Wilden JJ, van Krüchten A, Gieselmann L, Hrincius ER, Deinhardt-Emmer S, Haupt KF, Preugschas HF, Niemann S, Ludwig S, Ehrhardt C. 2020. The influenza replication blocking inhibitor LASAG does not sensitize human epithelial cells for bacterial infections. PLoS One 15:e0233052.
  24. Zell R, Gorbalenya AE, Knowles NJ, Simmonds P, Skern T. 2020. How to recognise and deal with dubious virus sequences? Infection Genetics and Evolution 81.
  25. Zell R, Groth M, Krumbholz A, Lange J, Philipps A, Dürrwald R. 2020. Cocirculation of Swine H1N1 Influenza A Virus Lineages in Germany. Viruses-Basel 12.
  26. Zell R, Groth M, Krumbholz A, Lange J, Philipps A, Dürrwald R. 2020. Novel reassortant swine H3N2 influenza A viruses in Germany. Sci Rep; 10(1):14296. 
  27. Zell R, Groth M, Krumbholz A, Lange J, Philipps A, Dürrwald R. 2020. Displacement of the Gent/1999 human-like swine H1N2 influenza A virus lineage by novel H1N2 reassortants in Germany. Arch Virol; 165(1):55-67.

2019

  1. Deinhardt-Emmer S, Haupt KF, Garcia-Moreno M, Geraci J, Forstner C, Pletz M, Ehrhardt C, Löffler B. 2019. Staphylococcus aureus Pneumonia: Preceding Influenza Infection Paves the Way for Low-Virulent Strains. Toxins (Basel) 11.
  2. Dornfeld D, Petric PP, Hassan E, Zell R, Schwemmle M. 2019. Eurasian Avian-Like Swine Influenza A Viruses Escape Human MxA Restriction through Distinct Mutations in Their Nucleoprotein. Journal of Virology 93.
  3. Egorova A, Ekins S, Schmidtke M, Makarov V. 2019. Back to the future: Advances in development of broad-spectrum capsid-binding inhibitors of enteroviruses. Eur J Med Chem 178:606-622.
  4. Fu YG, Dürrwald R, Meng FD, Tong J, Wu NH, Su A, Yin XP, Haas L, Schmidtke M, Zell R, Krumbholz A, Herrler G. 2019. Infection Studies in Pigs and Porcine Airway Epithelial Cells Reveal an Evolution of A(H1N1)pdm09 Influenza A Viruses Toward Lower Virulence. Journal of Infectious Diseases 219:1596-1604.
  5. Grienke U, Zwirchmayr J, Peintner U, Urban E, Zehl M, Schmidtke M, Rollinger JM. 2019. Lanostane Triterpenes from Gloeophyllum odoratum and Their Anti-Influenza Effects. Planta Med 85:195-202.
  6. Krumbholz A, Roempke J, Liehr T,  Groth M, Meerbach A, Schacke M, Maschkowitz G, Fickenscher H, Klapper W, Sauerbrei A, Wutzler P, Zell R. 2019. Macaca arctoides gammaherpesvirus 1 (strain herpesvirus Macaca arctoides): virus sequence, phylogeny and characterisation of virus-­‐transformed macaque and rabbit cell lines. Medical Microbiology and Immunology 208(1) 109-­129.
  7. Pfaff F, Glück B, Hoyer T, Rohlander D, Sauerbrei A, Zell R. 2019. Tungsten carbide nanoparticles show a broad spectrum virucidal activity against enveloped and nonenveloped model viruses using a guideline-standardized in vitro test. Letters in Applied Microbiology 69:302-309.
  8. Preugschas HF, Hrincius ER, Mewis C, Tran GVQ, Ludwig S, Ehrhardt C. 2019. Late activation of the Raf/MEK/ERK pathway is required for translocation of the respiratory syncytial virus F protein to the plasma membrane and efficient viral replication. Cell Microbiol 21:e12955.
  9. Raja V, Salsaa M, Joshi AS, Li Y, van Roermund CWT, Saadat N, Lazcano P, Schmidtke M, Huttemann M, Gupta SV, Wanders RJA, Greenberg ML. 2019. Cardiolipin-deficient cells depend on anaplerotic pathways to ameliorate defective TCA cycle function. Biochim Biophys Acta Mol Cell Biol Lipids 1864:654-661.
  10. Schloer S, Hubel N, Masemann D, Pajonczyk D, Brunotte L, Ehrhardt C, Brandenburg LO, Ludwig S, Gerke V, Rescher U. 2019. The annexin A1/FPR2 signaling axis expands alveolar macrophages, limits viral replication, and attenuates pathogenesis in the murine influenza A virus infection model. FASEB J 33:12188-12199.
  11. Wald J, Pasin M, Richter M, Walther C, Mathai N, Kirchmair J, Makarov VA, Goessweiner-Mohr N, Marlovits TC, Zanella I, Real-Hohn A, Verdaguer N, Blaas D, Schmidtke M. 2019. Cryo-EM structure of pleconaril-resistant rhinovirus-B5 complexed to the antiviral OBR-5-340 reveals unexpected binding site. Proc Natl Acad Sci U S A 116:19109-19115.
  12. Yinda CK, Esefeld J, Peter HU, Matthijnssens J, Zell R. 2019. Penguin megrivirus, a novel picornavirus from an Adelie penguin (Pygoscelis adeliae). Archives of Virology 164:2887-2890.
  13. Zell R, Groth M, Krumbholz A, Lange J, Philipps A, Dürrwald R. 2019. Displacement of the Gent/1999 human-­like swine H1N2 influenza A virus lineage by novel H1N2 reassortants in Germany. Archives of Virology 165(1) 55-­67.